איתי ינאי
פרס קריל 2013
טכניון
פרופ' איתי ינאי (Prof. Itai Yanai)
תחומי מחקר:
אבולוציה של מסלולים גנטיים התפתחותיים.
למרות שזה ידוע במשך למעלה מעשור שהגנום של חיה מכיל כ 02 אלף גנים, הבנת הפונקציה ההתפתחותית – וחדירותה לשינוי אבולוציוני נותרה עלומה. במעבדה שלי, ברצוננו להבין מסלולי התפתחות בהקשר של שינויים אבולוציוניים לרגולציית הגנום. המעבדה שלנו היא ייחודית בשימוש הבין תחומי של שיטות ניסיוניות וחישוביות. אנו משתמשים בשיטות אמבריולוגיים מורכבות על מנת לעבוד עם שושלות תאים, ואף ברמת התא הבודד. כמודל למערכת, אנו משתמשים בחיה המאופיינת ביותר, הנמטודה C. elegans . עם רוחב של שערה אחת ו – 1 mm ~ אורך, C. elegans מתרבה במהירת וביעילות, ונוחה לעבודה. פתחנו שיטות מולקולריות רגישות וחזקות לאנליזה של ה – transcriptomes ברמת התא הבודד של C. elegans . המבול של נתונים שאנו מייצרים דורש מסגרת עבודה חישובית הן לניתוח הנתונים בקנה מידה גדול והן ניתוח מפורט של תהליכים התפתחותיים. בהתאם לכך, כמחצית מאנשי המעבדה הם אנשי מחשבים העובדים בשיתוף פעולה הדוק עם ה- experimentalists ; וכמה מאתנו באמת בעלי מומחיות בשני התחומים. באופן קולקטיבי, זו מיומנות קבוצה ייחודית המאפשרת לנו להתמודד עם שאלות חדשות וחשובות, תוך שימוש בשיטות המתאימות ביותר הקיימות עד כה. המחקר בו אנו עוסקים כרגע סובב סביב הבנה של תהליכים התפתחותיים ואבולוציונים בגן ברמת הרגולציה הגנטית. ההתמקדות שלנו יכולה להיות מתוארת על ידי סדרה של שאלות. מה החתימה המולקולרית של שלבים מסוימים בהתפתחות? במאמר אחרון זיהינו שלב בהתפתחות נמטודות שמתאים להוות אבן דרך התפתחותית על פי מספר קריטריונים. אנו נמצאים כעת בתהליך של הרחבת ניתוח זה למספר מערכות רב והגדרת אבן דרך מאחדת הפאן מטזואניים. באיזו מידה הוא transcriptome מעוצב על ידי השושלות שלה מול גורל הרקמה? אנחנו שואלים אם לתאים בודדים משושלות שונות של תאים עדיין גורל זהה )לדוגמה, תאי שריר C. elegans), לשמור חתימת transcriptomic של שושלת היוחסין שלהם. האם שושלות תאי רקמה מסוימות מוטות בשימורם/חוסר שימורם של ביטוי הגנים? אנחנו ממפים את המשפחה של תאים מששת בלסטומרים המייסדים בהתפתחות המוקדמת של עובר C. elegans ו japonica .C והשוואת הדפוסים האבולוציוניים שלהם.